Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3CQ99985 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3CQ99985 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEMA3CQ99985 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3CQ99985 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms