Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PNKPQ96T60 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNKPQ96T60 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNKPQ96T60 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNKPQ96T60 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms