Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KC1Q96S38 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KC1Q96S38 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KC1Q96S38 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms