Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UIMC1Q96RL1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UIMC1Q96RL1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UIMC1Q96RL1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UIMC1Q96RL1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UIMC1Q96RL1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms