Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC43Q96MW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC43Q96MW1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC43Q96MW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC43Q96MW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC43Q96MW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC43Q96MW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC43Q96MW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC43Q96MW1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC43Q96MW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC43Q96MW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC43Q96MW1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC43Q96MW1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms