Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3IP1Q96FE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3IP1Q96FE7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3IP1Q96FE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms