Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF428Q96B54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ZNF428Q96B54 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF428Q96B54 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF428Q96B54 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ZNF428Q96B54 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF428Q96B54 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF428Q96B54 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF428Q96B54 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF428Q96B54 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF428Q96B54 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF428Q96B54 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF428Q96B54 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF428Q96B54 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms