Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRC59Q96AG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC59Q96AG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRC59Q96AG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC59Q96AG4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC59Q96AG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC59Q96AG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LRRC59Q96AG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms