Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRN2Q92932 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRN2Q92932 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRN2Q92932 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms