Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SUSD6Q92537 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD6Q92537 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD6Q92537 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD6Q92537 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD6Q92537 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms