Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf50Q8WW18 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf50Q8WW18 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C17orf50Q8WW18 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf50Q8WW18 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf50Q8WW18 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf50Q8WW18 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf50Q8WW18 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms