Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3BQ8TF42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBASH3BQ8TF42 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3BQ8TF42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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