Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RETREG2Q8NC44 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RETREG2Q8NC44 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RETREG2Q8NC44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RETREG2Q8NC44 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RETREG2Q8NC44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms