Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD9Q8NBP5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD9Q8NBP5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD9Q8NBP5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD9Q8NBP5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD9Q8NBP5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms