Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCML4Q8N228 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCML4Q8N228 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCML4Q8N228 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCML4Q8N228 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCML4Q8N228 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCML4Q8N228 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCML4Q8N228 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms