Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1B4

VPS52, Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS52Q8N1B4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS52Q8N1B4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS52Q8N1B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS52Q8N1B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS52Q8N1B4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS52Q8N1B4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS52Q8N1B4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS52Q8N1B4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS52Q8N1B4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms