Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPBP1Q86WP2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPBP1Q86WP2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GPBP1Q86WP2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPBP1Q86WP2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPBP1Q86WP2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPBP1Q86WP2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPBP1Q86WP2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPBP1Q86WP2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPBP1Q86WP2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GPBP1Q86WP2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms