Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALYREFQ86V81 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALYREFQ86V81 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALYREFQ86V81 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALYREFQ86V81 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms