Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD4Q7Z3J3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD4Q7Z3J3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD4Q7Z3J3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD4Q7Z3J3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD4Q7Z3J3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD4Q7Z3J3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD4Q7Z3J3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD4Q7Z3J3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD4Q7Z3J3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD4Q7Z3J3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RGPD4Q7Z3J3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD4Q7Z3J3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD4Q7Z3J3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD4Q7Z3J3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD4Q7Z3J3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD4Q7Z3J3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD4Q7Z3J3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD4Q7Z3J3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD4Q7Z3J3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms