Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2Y8

GVINP1, Interferon-induced very large GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GVINP1Q7Z2Y8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GVINP1Q7Z2Y8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GVINP1Q7Z2Y8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GVINP1Q7Z2Y8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GVINP1Q7Z2Y8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GVINP1Q7Z2Y8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GVINP1Q7Z2Y8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GVINP1Q7Z2Y8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GVINP1Q7Z2Y8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GVINP1Q7Z2Y8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GVINP1Q7Z2Y8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GVINP1Q7Z2Y8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GVINP1Q7Z2Y8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GVINP1Q7Z2Y8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GVINP1Q7Z2Y8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms