Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUX4L9Q6RFH8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms