Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PKN3Q6P5Z2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN3Q6P5Z2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN3Q6P5Z2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms