Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIGD3Q6B0B8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TIGD3Q6B0B8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TIGD3Q6B0B8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms