Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQA1Q5Y7H0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-DQA1Q5Y7H0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DQA1Q5Y7H0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DQA1Q5Y7H0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DQA1Q5Y7H0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms