Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAB7

RIPPLY2, Protein ripply2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY2Q5TAB7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY2Q5TAB7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY2Q5TAB7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPPLY2Q5TAB7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPPLY2Q5TAB7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY2Q5TAB7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY2Q5TAB7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPPLY2Q5TAB7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPPLY2Q5TAB7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPPLY2Q5TAB7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPPLY2Q5TAB7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPPLY2Q5TAB7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPPLY2Q5TAB7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPPLY2Q5TAB7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms