Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9E4

SLC25A53, Solute carrier family 25 member 53, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A53Q5H9E4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC25A53Q5H9E4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC25A53Q5H9E4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A53Q5H9E4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A53Q5H9E4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A53Q5H9E4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A53Q5H9E4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms