Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGO2Q562F6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGO2Q562F6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SGO2Q562F6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SGO2Q562F6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGO2Q562F6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SGO2Q562F6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGO2Q562F6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SGO2Q562F6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGO2Q562F6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGO2Q562F6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SGO2Q562F6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SGO2Q562F6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SGO2Q562F6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGO2Q562F6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGO2Q562F6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGO2Q562F6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SGO2Q562F6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SGO2Q562F6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SGO2Q562F6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SGO2Q562F6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms