Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC44A4Q53GD3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC44A4Q53GD3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A4Q53GD3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A4Q53GD3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms