Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf17Q53FE4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf17Q53FE4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf17Q53FE4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4orf17Q53FE4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms