Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM249Q2WGJ8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM249Q2WGJ8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM249Q2WGJ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms