Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTC1Q2NKJ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTC1Q2NKJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTC1Q2NKJ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTC1Q2NKJ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTC1Q2NKJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTC1Q2NKJ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms