Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCBQ16585 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCBQ16585 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCBQ16585 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCBQ16585 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms