Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZIC1Q15915 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIC1Q15915 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIC1Q15915 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms