Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB30Q15771 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAB30Q15771 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB30Q15771 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB30Q15771 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB30Q15771 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB30Q15771 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
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