Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SURF1Q15526 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SURF1Q15526 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SURF1Q15526 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SURF1Q15526 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
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