Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF235Q14590 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF235Q14590 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF235Q14590 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF235Q14590 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF235Q14590 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF235Q14590 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF235Q14590 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF235Q14590 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF235Q14590 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF235Q14590 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF235Q14590 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF235Q14590 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF235Q14590 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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