Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF4GQ14541 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HNF4GQ14541 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HNF4GQ14541 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HNF4GQ14541 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms