Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HNF4GQ14541 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HNF4GQ14541 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HNF4GQ14541 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HNF4GQ14541 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HNF4GQ14541 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HNF4GQ14541 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HNF4GQ14541 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HNF4GQ14541 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HNF4GQ14541 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HNF4GQ14541 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HNF4GQ14541 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HNF4GQ14541 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HNF4GQ14541 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HNF4GQ14541 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HNF4GQ14541 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNF4GQ14541 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNF4GQ14541 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HNF4GQ14541 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF4GQ14541 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF4GQ14541 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HNF4GQ14541 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNF4GQ14541 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNF4GQ14541 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNF4GQ14541 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNF4GQ14541 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNF4GQ14541 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNF4GQ14541 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF4GQ14541 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF4GQ14541 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNF4GQ14541 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNF4GQ14541 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HNF4GQ14541 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF4GQ14541 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF4GQ14541 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HNF4GQ14541 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HNF4GQ14541 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF4GQ14541 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNF4GQ14541 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNF4GQ14541 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNF4GQ14541 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNF4GQ14541 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNF4GQ14541 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNF4GQ14541 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNF4GQ14541 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNF4GQ14541 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNF4GQ14541 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNF4GQ14541 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HNF4GQ14541 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HNF4GQ14541 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF4GQ14541 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNF4GQ14541 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNF4GQ14541 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNF4GQ14541 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HNF4GQ14541 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNF4GQ14541 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HNF4GQ14541 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNF4GQ14541 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNF4GQ14541 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF4GQ14541 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF4GQ14541 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNF4GQ14541 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNF4GQ14541 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HNF4GQ14541 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HNF4GQ14541 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HNF4GQ14541 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HNF4GQ14541 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNF4GQ14541 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF4GQ14541 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HNF4GQ14541 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HNF4GQ14541 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HNF4GQ14541 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNF4GQ14541 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNF4GQ14541 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNF4GQ14541 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNF4GQ14541 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNF4GQ14541 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNF4GQ14541 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNF4GQ14541 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNF4GQ14541 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNF4GQ14541 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNF4GQ14541 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF4GQ14541 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF4GQ14541 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF4GQ14541 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF4GQ14541 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF4GQ14541 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF4GQ14541 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF4GQ14541 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNF4GQ14541 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF4GQ14541 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HNF4GQ14541 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HNF4GQ14541 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HNF4GQ14541 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HNF4GQ14541 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HNF4GQ14541 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HNF4GQ14541 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HNF4GQ14541 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HNF4GQ14541 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HNF4GQ14541 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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