Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRF5Q13568 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRF5Q13568 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRF5Q13568 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IRF5Q13568 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRF5Q13568 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
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