Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA4Q13156 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA4Q13156 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA4Q13156 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPA4Q13156 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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