Protein–RNA interactions for Protein: Q13023

AKAP6, A-kinase anchor protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 2,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP6Q13023 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKAP6Q13023 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP6Q13023 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AKAP6Q13023 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AKAP6Q13023 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AKAP6Q13023 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms