Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC20Q12834 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC20Q12834 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC20Q12834 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC20Q12834 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC20Q12834 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC20Q12834 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC20Q12834 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms