Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CALD1Q05682 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CALD1Q05682 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CALD1Q05682 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CALD1Q05682 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CALD1Q05682 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CALD1Q05682 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CALD1Q05682 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CALD1Q05682 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CALD1Q05682 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CALD1Q05682 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CALD1Q05682 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CALD1Q05682 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CALD1Q05682 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CALD1Q05682 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CALD1Q05682 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CALD1Q05682 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CALD1Q05682 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CALD1Q05682 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CALD1Q05682 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CALD1Q05682 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CALD1Q05682 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CALD1Q05682 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CALD1Q05682 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CALD1Q05682 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
CALD1Q05682 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CALD1Q05682 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CALD1Q05682 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CALD1Q05682 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CALD1Q05682 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CALD1Q05682 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms