Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IL13RA1P78552 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL13RA1P78552 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL13RA1P78552 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL13RA1P78552 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms