Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKP1P63208 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SKP1P63208 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKP1P63208 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKP1P63208 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKP1P63208 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKP1P63208 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKP1P63208 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKP1P63208 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKP1P63208 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKP1P63208 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKP1P63208 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKP1P63208 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKP1P63208 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKP1P63208 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKP1P63208 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKP1P63208 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKP1P63208 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKP1P63208 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKP1P63208 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SKP1P63208 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKP1P63208 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKP1P63208 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKP1P63208 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKP1P63208 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKP1P63208 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKP1P63208 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKP1P63208 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SKP1P63208 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKP1P63208 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKP1P63208 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKP1P63208 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKP1P63208 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKP1P63208 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKP1P63208 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SKP1P63208 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKP1P63208 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKP1P63208 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKP1P63208 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKP1P63208 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SKP1P63208 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKP1P63208 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKP1P63208 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKP1P63208 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKP1P63208 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKP1P63208 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKP1P63208 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKP1P63208 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKP1P63208 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKP1P63208 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKP1P63208 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKP1P63208 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKP1P63208 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKP1P63208 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKP1P63208 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKP1P63208 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKP1P63208 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKP1P63208 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKP1P63208 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKP1P63208 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKP1P63208 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKP1P63208 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKP1P63208 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKP1P63208 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKP1P63208 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKP1P63208 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKP1P63208 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKP1P63208 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKP1P63208 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKP1P63208 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKP1P63208 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKP1P63208 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKP1P63208 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKP1P63208 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKP1P63208 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKP1P63208 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKP1P63208 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKP1P63208 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKP1P63208 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKP1P63208 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SKP1P63208 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKP1P63208 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SKP1P63208 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKP1P63208 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKP1P63208 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKP1P63208 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKP1P63208 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKP1P63208 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKP1P63208 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKP1P63208 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKP1P63208 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKP1P63208 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKP1P63208 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKP1P63208 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKP1P63208 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKP1P63208 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SKP1P63208 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKP1P63208 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKP1P63208 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKP1P63208 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms