Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF3P61204 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF3P61204 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF3P61204 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF3P61204 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF3P61204 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF3P61204 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF3P61204 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF3P61204 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF3P61204 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF3P61204 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF3P61204 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF3P61204 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARF3P61204 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF3P61204 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF3P61204 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF3P61204 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF3P61204 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF3P61204 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF3P61204 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF3P61204 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF3P61204 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF3P61204 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF3P61204 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF3P61204 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF3P61204 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF3P61204 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF3P61204 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF3P61204 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF3P61204 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF3P61204 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF3P61204 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF3P61204 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF3P61204 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF3P61204 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF3P61204 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF3P61204 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF3P61204 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF3P61204 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF3P61204 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF3P61204 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF3P61204 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF3P61204 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF3P61204 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF3P61204 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF3P61204 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARF3P61204 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARF3P61204 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF3P61204 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF3P61204 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF3P61204 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF3P61204 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF3P61204 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF3P61204 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF3P61204 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF3P61204 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF3P61204 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF3P61204 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF3P61204 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF3P61204 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARF3P61204 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARF3P61204 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARF3P61204 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF3P61204 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF3P61204 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF3P61204 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF3P61204 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF3P61204 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARF3P61204 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARF3P61204 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARF3P61204 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF3P61204 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF3P61204 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF3P61204 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF3P61204 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF3P61204 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF3P61204 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF3P61204 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF3P61204 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF3P61204 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF3P61204 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF3P61204 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF3P61204 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF3P61204 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF3P61204 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF3P61204 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF3P61204 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF3P61204 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARF3P61204 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF3P61204 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF3P61204 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF3P61204 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF3P61204 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF3P61204 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF3P61204 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF3P61204 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF3P61204 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF3P61204 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF3P61204 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF3P61204 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 437.1 ms