Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH15P55291 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH15P55291 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH15P55291 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH15P55291 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH15P55291 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH15P55291 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH15P55291 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH15P55291 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH15P55291 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH15P55291 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH15P55291 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH15P55291 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH15P55291 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH15P55291 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH15P55291 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH15P55291 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH15P55291 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH15P55291 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH15P55291 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH15P55291 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH15P55291 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH15P55291 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH15P55291 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH15P55291 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH15P55291 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH15P55291 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH15P55291 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH15P55291 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH15P55291 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH15P55291 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH15P55291 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH15P55291 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH15P55291 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH15P55291 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH15P55291 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH15P55291 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH15P55291 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH15P55291 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH15P55291 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH15P55291 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH15P55291 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH15P55291 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH15P55291 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH15P55291 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH15P55291 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH15P55291 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH15P55291 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH15P55291 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH15P55291 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH15P55291 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH15P55291 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH15P55291 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH15P55291 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH15P55291 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH15P55291 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH15P55291 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH15P55291 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH15P55291 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH15P55291 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH15P55291 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH15P55291 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH15P55291 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH15P55291 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH15P55291 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH15P55291 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH15P55291 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH15P55291 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH15P55291 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH15P55291 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH15P55291 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH15P55291 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH15P55291 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH15P55291 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH15P55291 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH15P55291 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH15P55291 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH15P55291 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH15P55291 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH15P55291 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH15P55291 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH15P55291 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH15P55291 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH15P55291 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH15P55291 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH15P55291 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH15P55291 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH15P55291 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH15P55291 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH15P55291 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH15P55291 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH15P55291 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH15P55291 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH15P55291 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH15P55291 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH15P55291 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH15P55291 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH15P55291 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH15P55291 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH15P55291 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms