Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN5P54829 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN5P54829 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN5P54829 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN5P54829 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms