Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AP3M2P53677 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AP3M2P53677 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AP3M2P53677 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms