Protein–RNA interactions for Protein: P51153

RAB13, Ras-related protein Rab-13, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB13P51153 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB13P51153 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB13P51153 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB13P51153 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB13P51153 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB13P51153 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB13P51153 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB13P51153 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB13P51153 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB13P51153 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB13P51153 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB13P51153 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB13P51153 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB13P51153 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB13P51153 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB13P51153 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB13P51153 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB13P51153 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB13P51153 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB13P51153 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB13P51153 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB13P51153 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB13P51153 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB13P51153 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB13P51153 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB13P51153 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB13P51153 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB13P51153 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB13P51153 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB13P51153 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB13P51153 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB13P51153 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB13P51153 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB13P51153 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB13P51153 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB13P51153 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB13P51153 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB13P51153 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB13P51153 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB13P51153 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB13P51153 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB13P51153 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB13P51153 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB13P51153 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB13P51153 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB13P51153 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB13P51153 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB13P51153 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB13P51153 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB13P51153 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB13P51153 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB13P51153 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB13P51153 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB13P51153 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB13P51153 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB13P51153 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB13P51153 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB13P51153 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB13P51153 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB13P51153 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB13P51153 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB13P51153 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB13P51153 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB13P51153 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB13P51153 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB13P51153 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB13P51153 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB13P51153 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB13P51153 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB13P51153 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB13P51153 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB13P51153 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB13P51153 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB13P51153 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB13P51153 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB13P51153 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB13P51153 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB13P51153 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB13P51153 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB13P51153 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB13P51153 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB13P51153 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB13P51153 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms